Este Rio nasce da confluência de dois outros rios, o Juruena e o São Manuel (Teles Pires) e deságua no Rio Amazonas, em frente à cidade de Santarém, percorrendo 1784 Km em território Brasileiro. É responsável pela descarga de cerca de 6% da água doce do Rio Amazonas.

 

O seu nome derivou de uma tribo índia de nativos americanos da cidade de Santarém.

 

É um Rio de águas claras, um dos 3 principais da Bacia Amazónica, a par com o Rio Xingu e o Rio Tocantis, caracterizados por terem baixa condutividade e dureza, assim como de água em média ligeiramente ácida (pH 6,5). Porém, e de acordo com as estações de seca e de cheias, o pH poderá ficar mais ácido ou um pouco mais alcalino, mas nunca mantendo o nível médio de acidez característico dos rios de águas negras (black water), e a temperatura oscilar entre os 24ºC e os 30ºC.

 

Existem inúmeras espécies de peixes no Rio Tapajos, tendo sido descobertas uma boa parte delas na última década, e muitas delas são endémicas, ou seja, existem apenas nestas águas.